拥有了如此大权力的克林斯曼，当然需要表现出与权力匹配的水准。克林斯曼做到了：他承诺球队要年轻化，在他率领球队所打的第二场比赛中，也就是在柏林对阵巴西队，在这一世人瞩目的比赛中，克林斯曼将球员的平均年龄降到了22岁，这需要多大的勇气。结果德国队以1比1战平了巴西队；他承诺攻势足球，结果在他率队参加2005年联合会杯所打的5场比赛中，德国队一共打进了15个球，场均3球。
虽然在半决赛中德国队再次负于巴西队，但这场失利，已经与2002年的失利不可同日而语了：2002年的失败，是一场没有反抗力的完败，但2005年这场失利则是巴西队先进球，德国队扳平，巴西队再进球，德国队再扳平，然后巴西人在终场之前费尽九牛二虎之力才摆平了这支年轻的德国队，两队对攻场面之激烈，让现场观战的球迷如醉如痴。
联合会杯之后，克林斯曼聘请了科隆体院的技术团队来为德国队收集所有对手的技术数据进行分析。具体的运作，是由科隆体院的足球教授布施曼率领他的学生来操作完成的。但这一决定同样遭遇了很多人的批评，这些批评不但来自足协内部，还来自德甲各方面的专家。他们无法接受这样一个事实：一个连教练都没怎么做过的克林斯曼，突然就从美国空降过来，然后告诉德国人，足球应该是这样踢的，而不是你们那样玩的。这对已经三夺世界冠军的德国足球精英来说，是赤裸裸的挑衅。此外，以贝肯鲍尔和赫内斯为首的一些大佬，也在不断地指责克林斯曼的心不在德国队，因为他总是在德国停留不长的时间就“飞回加利福尼亚享受阳光”了。克林斯曼对此的解释是，不在德国，就能更好地不受干扰的工作。
对于所谓来自专业人士的批评，克林斯曼反驳说：“我们尊重各位专家，也邀请他们来德国队看看。像布莱特纳所说的，我们在培养田径运动员的说法，显然是站不住脚的。很多人问，美国人和瑞士人能做什么？这其实是很失礼的。德国人不应该这样骄傲，觉得自己什么都能干，是世界上最成功的国家，因此视野只需在德国境内就可以了——这是非常狂妄的。”
通过一系列的改造，克林斯曼树立了自己在球队中的绝对权威，他只看重球员的状态水准，而不是名气，最典型的例子是关于门将的选择。2004年年底，克林斯曼请来了新的门将教练科普克，而弃用了卡恩十分喜欢的迈耶。克林斯曼在执教初期就让卡恩与莱曼轮流守门，以竞争来促进两人提高水平。卡恩与巴拉克，就是德国国家队的代表人物，让卡恩参与轮换，需要多大的勇气和决心，要面临多大的风险和压力，但克林斯曼无所畏惧。
虽然卡恩在上次世界杯中有出色的发挥，并被认为是当时德国最好的门将，但由于受拜仁全队状态低迷所累，在2006年世界杯前，卡恩的状态并非很稳定。所以在世界杯前克林斯曼宣布，莱曼成为德国队的一号门将，卡恩尽管很不情愿，但他也知道，在这样重大的比赛中，德国队需要两名高水准门将。因此，他并未像《图片报》所说的那样，选择含恨退出国家队，而是坐在替补席上，继续支持德国队。卡恩的队长袖标，则交给了巴拉克。除了卡恩之外，克林斯曼还对像沃恩斯和哈曼这样的老将痛下杀手，他们未能进入德国队的大名单，而像奥东克尔这样特点鲜明的球员，则出人意料地入选了国家队。
由于德国是2006年世界杯的主办国，所以克林斯曼的国家队并没有参加世界杯资格赛的任务，而只能通过友谊赛寻找球队的不足。克林斯曼的改革也并非完全是一帆风顺。在他执教的初期，为了加强球队攻击力，采用的是“442”菱形站位，也就是4名中场中设一名前腰，一名后腰，这种踢法在加强了球队攻击力的同时，也使得本队的后防线暴露在对方的炮火之下。在2005年年底的热身赛上，德国队先后输给了斯洛伐克队与土耳其队，而在2006年3月1日，德国队在佛罗伦萨客场输给了老对手意大利队，在意大利人的高效面前，德国队显得如此不堪一击。
可以想象克林斯曼承受了多大的压力，特别是在他缺席了国际足联在杜塞尔多夫所举办的世界杯工作会议，而其他世界杯球队的主帅又都参加了之后，质疑的口水几乎将克林斯曼淹死。克林斯曼知道，凡是改革家，就难免会受到阻力，他现在所能做的，只能是迎难而上。
虽然仅仅是一场友谊赛，但这是一场不同寻常的友谊赛，对克林斯曼在2006年世界杯上的决策有着重要的影响。不妨先看看那时候的阵容：莱曼为门将，弗里德里希、默特萨克、胡特和拉姆为后卫，弗林斯为后腰，巴拉克为前腰，代斯勒与施奈德分别担任两前卫，克洛泽与波多尔斯基在锋线搭档。克林斯曼在比赛中换了两个人：施魏因斯泰格对位换下施奈德，而梅策尔德替下默特萨克。这已经是德国队的最强阵容了，但在意大利人面前还是不堪一击。勒夫后来总结说：“当时是很惨的。我们缺乏系统组织，之前把过多的精力投入到进攻。但这场惨败之后，我们决定，必须加强防守，球队必须做到攻守平衡。”这样做的一个具体变化就是，将菱形站位的中场配备改成了双后腰配备。
3月22日，德国队在多特蒙德对阵美国队。所有人都知道，这是德国队必须取胜的比赛。德国足协主席茨旺齐格后来在自己的个人传记中提到，他有一种很强烈的改革失败了的感觉，甚至决定如果德国队输球，就立刻用萨默尔取代克林斯曼——尽管那时离世界杯开幕只有79天了。好在德国队以4比1取胜，克林斯曼得以继续执教。但在这场比赛之前，克林斯曼得到了一个糟糕的消息，中场主力代斯勒膝盖严重受伤，将肯定无缘2006年世界杯的比赛。
联赛结束之后，球队开始了紧张的世界杯备战工作，在撒丁岛集训期间，克林斯曼甚至允许家属陪同，这在以前可是绝无仅有的。整个情况与当年“马伦特之夜”不同，备战完全是在一种轻松的状态下进行的。
离世界杯已经没有几天了，话题集中在队长巴拉克身上，巴拉克受伤了。但他仍然希望在揭幕战中出场，却被克林斯曼拒绝了：“我理解他的心情，但我们不能冒险。”这就是克林斯曼的风格，没有人能改变。6月7日，德国总理默克尔拜访了德国队，6月8日齐根塔勒来了，但哥斯达黎加的战术，并不是他所汇报的重点，他为联邦德国队播放了一张DVD（数字多功能光盘），光盘里都是介绍哥斯达黎加的风土人情，齐根塔勒希望用这种方式加深球队对哥斯达黎加的了解。
