治水除患、兴利安民，自古以来就是当政者的大事，南京历史上有过多次治水的记录。其中值得一提的是晚清名臣左宗棠在南京的治水事迹。
左宗棠
在清代的两江总督中，左宗棠（1812-1885）是任职时间较短的一位。从光绪七年十二月二十二日（1882年2月10日）在南京正式接印，到光绪十年三月十三日（1884年4月8日）交印给继任者曾国荃，只有两年零两个月的时间。而这位年已七旬、身患疾病的老将却在海防、盐务、水利、矿业以及文化建设上都做了诸多实事。
对江南的水利建设，他在给朝廷的《病势增剧恳恩开缺回籍折》中表示：“此次莅任江南，惭无报称，惟农田水利一事躬亲相度。”因此，他一上任便设立水利局，并巡视各地，察看水道，了解灾情，统筹规划。他运用长期治理西北的经验，依靠部队，在南京地区建成赤山湖、朱家山河、通济闸等一批在当时可说是大型的水利工程。
首战赤山湖
赤山湖位于秦淮河东边源头句容河的上游，主要汇积茅山、浮山、虬山等下来的诸水，缓冲夏季的山洪，历史上灌溉农田曾达万顷。由于年长日久，水土流失，湖床淤垫，加上周边不断地围垦造田，湖面越来越小。据相关资料，三国孙吴开挖的赤山湖周长在120里以上，到明代缩为60里，晚清时仅有40里。湖身缩小，容量锐减，每年夏季难以蓄存暴发的山洪，造成下游圩堤溃决，农田受淹，高淳、江宁诸县均受其害，上游也因水流不畅，积涝成灾，成为当时一大水患。
赤山湖湿地
据《南京水利志》等书所记，光绪八年十月，左宗棠在亲自踏勘后，决心整治赤山湖水道。由于当时缺少经费，百姓又民穷力困，他毅然决定调动驻防的湘军和淮军共五千余人，承担疏浚河道、挑挖土方等任务。历时一年四个月，将淤塞的新旧水道逐段疏通，“计长二十里有余，均一律挑浚深通，圩堤加高培宽，捶筑坚固，沿埂栽种桑秧以护堤而兴利，其下游之三汊族业经开浚，再行接挑秦淮河道，以畅其流。又修建陈家边闸及陈家村木桥各一座。”整个赤山湖水利工程共用银二万八千四百余两。
大战朱家山
滁河是南京长江北岸的一条重要河流，它承收安徽滁州、来安、全椒地区下注的山水以及定远、合肥等地的部分来水，绕六合二百余里而通向长江。由于缺少分洪渠道，每当山洪陡发、大量山水经支流骤至之际，本就弯曲狭窄纡缓的滁河又受长江大潮的顶托，难以及时泄洪，常常造成洪灾，致使滁州地区和江浦、六合两县的数十万顷的圩田悉成泽国，百姓深受其苦。从明代中期开始，就有开挖朱家山河分泄滁河洪峰的议论，但直到晚清，终因权势之争、工费艰巨，尤其是朱家山岩石坚硬难以开挖而成为纸上谈兵。
朱家山河
左宗棠经过调查访问，决定开挖朱家山河，这是在浦口地区为滁河开凿一条通达长江的分洪工程。上自滁河张家堡起，经板桥，穿过朱家山，至浦口南门出老江口进入长江。这朱家山“山石高数十丈，横亘十余里”，左宗棠一面奏准朝廷动用“盐票”积款十七万七千八百多两白银为工程费用；一面派旧部王德榜专攻朱家山；同时调派十一个营的兵力用于河工。王德榜所率的清兵曾是整治北京永定河的主力，他们依照以往的经验，凿石穿孔，充填火药，引信爆破，层层轰炸，终于打通朱家山。不到两年，朱家山河开挖完成，共挑土331万立方米，运石近26万立方米，对滁河中下游流域的旱季引水、雨季泄洪起到了很好的作用。
苦战通济闸
源自句容和溧水的秦淮河，流至南京通济门外九龙桥处分为两支，一支（旁支）沿明城壕向南，经长干桥，至赛虹桥又分两支，分别沿石头城经三汊河入江和过江东桥经北河口入江，称为外秦淮；一支（正支）由东水关入城，穿过市区南部，与珍珠河、青溪诸水汇流，出西水关与外秦淮河复合，称为内秦淮，也就是人们常说的“十里秦淮”。
东水关闸口旧影
从明末开始，内秦淮河就日见淤积，随着沿岸人居增多，插桩建屋，侵占河道，抛撒垃圾，河身变窄，水流不畅，水患频发；清代康熙、嘉庆年间都曾清淤整治，但收效甚微。至光绪年间已严重淤塞，春夏水涨，泛滥成灾，秋冬水涸，舟楫不通；更有甚者河水被高度污染，秽浊不堪，难以饮用。在左宗棠之前，当政者曾多次商议疏通，均未有结果。
秦淮河东水关
光绪八年十月，左宗棠又一次动用兵力，疏浚河道，他接受候补道员王诗正的建议，在通济门外中和桥下筑建石闸，秋冬季节闭闸蓄水；同时修复东、西两水关的闸板，相机启闭。开东水关灌以清流，开西水关以泄浊水，让内秦淮河水逐渐变清。修建水闸时，正当寒冬，又遇到土质松软，必须加打木桩。他在《新建通济门外石闸碑记》中写道： “桩深至二尺余，鳞次密排，始能筑石。又兼天雨不时，诸将士日事畚掘（盛土和抬土的工具），经营于烈风淫雨之中，劳瘁周一寒暑，至九年十二月而闸工始成。命曰：‘通济闸’。”新建的通济闸长二十四丈，宽三丈六尺，高二丈六尺。有闸门五道，上面建屋五间，派专人掌管。“于是水源以清，又无碍舟楫，人称便焉。总计工料所需为银四万数千两。”
除以上三大工程外，左宗棠还在金川门修建了调控金川河的水闸，整治门内外河道；并在位于龙潭镇的江中带子洲上开沟、架桥、筑堤、建闸，惠及一方民众。
对左宗棠在南京治水除患一事，《秦淮感旧集》有这样的记述和评论：“左太保（指左宗棠）驻节金陵时，曾通青溪秦淮之利。上元秦伯虞（即秦继唐，上元县人）称为数百年封疆大吏，所徬徨瞻顾、屡举屡辍、有志而未逮（及）者，公则毅然为之。排浮言，考故道，于费无所惜，于力无所靳（吝啬）。规复秦淮之景者曾太傅，规复秦淮之水道者左太保也。”文中所谓“规复秦淮之景”，是指清军攻占南京后，曾国藩为振兴经济，恢复秦淮画舫、不禁歌伎之事。
