面对日本本土，美国陆军部长史汀生估计，如果登陆日本本土，光是在关东平原和东京-横滨城市战中，美军就将伤亡170-400万人，其中阵亡约40-80万人。丘吉尔回忆，英美认为如果发动日本本土登陆战，那么，将有100万美国人和50万英国人丧生。登陆战第一阶段登陆九州岛的战斗将在1945年11月11日打响。
日本战败后，美国在日本本土缴获的潜艇。
实际上，美军的计算依据主要是冲绳和硫磺岛战役，如果一旦美军真的发动日本本土登陆战，所要承受的伤亡和战斗时间将远远超过预期，因为，美国低估了本土日军的综合实力。
1945年1月，日军大本营报告指出，美军将在1945年9月以后发动对日本本土的大规模登陆战。现在的全部任务都将围绕本土决战展开。在海上战斗力已经丧失、而空军兵力又极缺乏的本土决战中，决定胜败势必要在地面决战中；实际上，重担不得不落在陆军肩上。全部作战计划代号为决号作战。
日本将战备的重点置于关东地方和九州地方。要求对登陆之敌，展开果敢的地面攻势，力求速战速胜。 在集中兵力时，预料美军将破坏交通，因此做计划时是以徒步行军为前提的；但如果情况允许，当然要利用铁路、船舶。
实行国家总武装，以军、官、民的全部力量来对付登陆的美军。 不仅要进行军团决战，还要配合游击战，以师管区部队、警备队（由在乡军人组编）与官、民义勇军组织等，进行游击、侦察、诱骗、妨碍宿营等游击活动。
驻防日本本土的一式战车部队。
在本土实施兵力大动员，召集本土大部份退伍军人组建新师团，从200号起的番号为决战师团，300号起的番号为沿岸配备师团。
动员兵力包括陆、海军合计约达240万人，加上原有部队合计380万人，上述日军在国内之防御部队，共为72个师团（包括8个航空师团），又35个旅团。其中45个师团和24个旅团，是在1945年的2月、4月、5月、6月份4次仓促编成。
航空战斗力：约有10000架飞机（其中约75%为教练机改装的特攻机），海上特攻战斗力：约有3300只舟艇。另外国民义勇战斗队的组成人员2800万人。
大概作战计划为，当美军登陆舰队开始逼近日本本土，特别是进入停泊地前后，神风特攻队将出动5825架自杀飞机对美军登陆舰队进行不分昼夜的10天强攻，每天都将有数百架神风飞机满载烈性炸药冲向美军登陆舰，以求最大程度的杀伤美军有生力量，打乱美军登陆编组。
到9月底，日本海军还将组建一支拥有1000架“樱花”、“橘花”、“藤花”特攻机，其中“橘花”将备有两个喷射推进器，以最大速度冲向美军军舰，使美军来不及拦截。
日本橘花式喷射战机。
修建新的飞机场和构筑飞机的掩体，是为了进行全面航空特攻作战。到7月末，本土的机场总数，包括建设中的机场在内，共达325处，其中秘密机场为95处。
日本军令部总长丰田副武说：“美军如果提前来进攻本土，虽然不可能全部消灭它，但确信可以在它到达海岸之前，消灭其近半数。”
当美军开始登陆时，日本海军将出动3300艘特攻快艇进行近距离冲刺，消灭美军大部于换乘时节，最或者打乱其登陆顺序。
为避免美军强大舰炮火力，日本陆军将在海岸线以后的高地洞窟阵地迎战美军。并且当部分美军由登陆艇群到达滩头时，日军在预先部署好的炮兵群、坦克群、空军机群、反坦克炮群及轻火器的支援下进行连续的逆袭。出动突击队在陆军重炮掩护下反复冲击美军登陆点。阻止美军建立桥头堡，并将敌我战线引入交错混战状态，使美军难以进行轰炸和舰炮射击。
沿岸守备师团将尽全力阻挡疲惫美军，当美军突破消灭他们后，将会精疲力尽的进入纵深地域，到时各个机动打击师团将集中所有重炮，坦克和大兵团发起排山倒海般的大反攻。
日本本土上的自行火炮。
在东京，已经开始构筑可以容纳3个师团的地下工事群，一旦美军打到东京，这3个师团将依托地下坑道工事进行坚守，消耗美军有生力量。最后的决战之地，在长野县的松代山区，陆军省1944年起，就秘密开始修建工程。为了能经受强烈的轰炸，该项工程是用混凝土加固的坑道设施；1945年7月，已大致完成。在最后时刻，天皇政府官员以及日本核武器专家将隐蔽在这里。而2个近卫师团将同美军进行最后的决斗。
日本本土大决战的残酷性将远远超过冲绳，硫磺岛和佩里硫岛。首先很多200序列师团都是当初的精锐师团，例如第201、202、205、206、209、212、214、216师团，就是当初的精锐第1,2,5,6,9,12,14,16师团老兵改编的。
他们的武器配备是，一个师团步枪7943支，冲锋枪288把，轻机枪291挺，重机枪131挺，火焰喷射器12具，掷弹筒336具，速射炮12门，山炮12门，双联高射机关炮7门，120毫米迫击炮24门。主要任务是滩头反击，所以近战型枪炮比较多。
驻防日本本土的三式战车部队。日本不是没有重装甲部队，而是运不出去，只能留在本土。况且日本没有美国那种超强工程能力，就是把重装甲运输到太平洋小岛礁也是寸步难行，而作为一个岛国，飞机和船才是最重要的，就是有10万辆重型坦克，运不出去，摆在岛上也毫无作用。所以，日本在本土决战计划以前对重装甲武器兴趣不大。到了本土决战时期，由于重装甲武器可以在面积较大的日本本土执行反击任务，才被有限的重视起来。不光是日本，二战时期，苏联和德国也没有能力把重型装甲部队运送过辽阔的大洋，并且保障其作战。
负责守备海岸线的沿岸守备师团的配备是一个师团。步枪7075支，冲锋枪288把，火焰喷射器24具，轻机枪174挺，重机枪143挺，掷弹筒？，步兵炮54门，速射炮24门，山炮8门，200毫米单管火箭炮50门（日本陆军同样大量装备了火箭炮和火箭筒，只是没有出现在中国战场，而且日本陆军也喜爱牵引式单管火箭炮），他们的配备也是近战型武器多，大火力武器多。
负责大反攻的部队，例如第25师团的配备是，步枪10137支，轻机枪279挺，重机枪114挺，掷弹筒270具，步兵炮36门，速射炮36门，山炮48门，重型迫击炮12门，这种负责反击的师团武器相对，近战武器少，火炮较多。
如果对抗美军坦克，本土日军同样有大量手段，例如；德军打坦克神器88毫米高炮，日本也有500门以上。
日本陆军在太平洋弹药奇缺是海运能力的限制和美军无所不在的海上绞杀战，由于这种限制，所以日本生产的加农炮，野战炮和重炮以及弹药，大部分都无法运输到战区，只能堆放在本土。因此无论是在冲绳，硫磺岛还是在佩里硫，新几内亚战斗，一个日本兵只有100-230发子弹，一门火炮只有20-100发炮弹。
日本本土装甲部队。日本本土堆积大量武器弹药和部队，就不想出去吗？实际上是出不去，美军掌握了太平洋上的制海权和制空权，如果日军敢坐着运输船出去几乎就等于是自杀，在海上就会被美军轻易歼灭了。
而在本土，日军将拥有大量弹药，美军占领日本本土后，惊讶的发现，日本本土竟然有如此众多的武器弹药，光是驻于长崎的美国海军陆战第2师和驻于佐世保的美国海军陆战第5师，从1945年11月13日开始，就向以西五岛列岛之各海域，投入了约80万吨各种弹药和武器。
从1945年9月30日至1946年4月，美军光是向日本的周围各海域，就投入了步枪165万支，骑枪25000支，还有大批武器采取爆炸方法销毁。所谓日本本土缺乏武器，主要是指日本正规军和义勇队合计超过3000万人，那么武器是不足的，虽然在早期组建时，武器发放出现混乱，导致不足，但是到日本投降时，其本土正规军武器还是充裕的，竹枪那是2800万义勇队的配备，日本当时没有能力给2800万义勇队全部配备武器。
美军在日本本土收缴了14500门大炮和40000具掷弹筒，各种炮弹多达7700万发，所有弹药加在一起多达119万吨。要知道造成数万美军伤亡的冲绳战役，日军才只有2.3万发炮弹。在弹药充足，重炮力量强大，有饭团吃的时候，本土日军的战斗力将是冲绳日军的多少倍。
如果说美军可以利用轰炸机先轰平日军所有阵地，才轻松登陆，那么图上的小岛，就是著名的硫磺岛，一个真正的弹丸小岛，而且这个小岛绝大部分地方还相对都是平地。就这么1个两个机场大的小岛，日军挨了美军5万吨各种弹药的轰击，美军也没有轰平日军的阵地，最后还是靠6万美军一点点的地面攻击了一个月才攻克这个巴掌大的地方。而日本本土是这个小岛的18900倍，美军需要砸多少弹药才可以轰平日军的所有阵地？18900乘以50000是多少吨弹药？（图中跑道，就是机场跑道，可见这个小岛有多大）
美国面对上万架神风飞机，1.4万门大炮，数千辆坦克，119万吨弹药和300万决心在本土保护天皇的狂热日本将兵，美军做出的最佳选择就是投掷原子弹。
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